Powstałe w 1959 roku Muzeum Etnograficzne od początku swojego istnienia mieści się w dawnym XIX wiecznym Arsenale artyleryjskim. Ponadto muzeum obecnie zajmuje również budynek poforteczny twierdzy Toruń, dwa spichlerze (ul. Rabiańska) oraz skansenowe ekspozycje budownictwa ludowego. Patronem muzeum od 1999 roku jest Maria Znamierowska - Prüfferowa, która była jego założycielem.
Muzeum dokumentuje historię kultury ludowej na Kujawach, Pałukach, Kaszubach i ziemi chełmińskiej. Wykorzystanie nagrań audio, zapisów filmowych oraz multimedialnych prezentacji niewątpliwie są atutem wystaw. Obecnie w Arsenale znajduje się ekspozycja stała pt. "Tajemnice codzienności. Kultura ludowa i jej pogranicza od Kujaw do Bałtyku (1850-1950)" oraz "Salonik prof. Marii Znamierowskiej-Prüfferowej." Muzeum organizuje również wystawy czasowe oraz wydarzenia propagujące kulturę ludową.