Muzeum mieści się w jedenastu odbudowanych po wojnie staromiejskich kamienicach. Obejmuje również trzy zabytkowe dziedzińce.
Muzeum w swoich zbiorach posiada m.in.: eksponaty archeologiczne, malarstwo, grafikę, ikonografię, rzeźby, rzemiosło artystyczne, numizmatykę, plany i rysunki. Część z nich, udostępniona w ekspozycji stałej „Siedem wieków Warszawy”, pokazuje dzieje miasta od jego założenia po czasy współczesne.
W muzealnym kinie można obejrzeć film dokumentalny o Warszawie.