Lubaczowskie muzeum zrodziło się z pasji kolekcjonerskiej Włodzimierza Czerneckiego, zasłużonego społecznika i pedagoga lubaczowskiego. Działalność zbieracką zapoczątkował już w latach 30. XX w.
Dział archeologiczny gromadzi znaleziska pradziejowe i średniowieczne z terenu powiatu lubaczowskiego. Trzon zbioru tworzą przypadkowe znaleziska zabytków przekazane do muzeum jako dary przez osoby prywatne.
Działalność Działu Etnograficznego Muzeum w Lubaczowie obejmuje obszar ujęty granicami powiatu lubaczowskiego. Teren ten pod względem etnograficznym należy do tzw. „Pogranicza Nadsańskiego”.
Zgromadzone w dziale artystycznym zabytki należą do bogatego, wielokulturowego dziedzictwa kresowego. Obejmują takie dziedziny sztuki jak: malarstwo, rzeźba, rzemiosło, tkanina, rysunek. Głównym obszarem zainteresowania działu jest ziemia lubaczowska oraz dawne Kresy.
Dział historyczny zajmuje się gromadzeniem, katalogowaniem, konserwowaniem oraz naukowym opracowywaniem pozyskiwanych zbiorów jak również przechowywaniem i nadzorem nad ich stanem zachowania.